为什么用16sRNA鉴定菌种 为什么用16srrna做菌种鉴定

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细菌鉴定中到底是16srDNA测序还是16srRNA测序?

细菌鉴定中测序测的是16S rDNA基因，因为RNA是不稳定的。

16S rDNA因其序列在物种间的高度多样性，成为细菌分类学研究的“分子钟”，素有“细菌化石”之称。

16S rDNA基因全长1542 bp，由9个可变区和10个保守区组成。其中保守区反映了生物物种间的亲缘关系，而可变区则表明物种间的差异，且变异程度与细菌的系统发育密切相关。

16srDNA测序包括细菌基因组DNA提取、16SrDNA特异引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。是一种快速获得细菌种属信息的方法。英文名称是16S ribosomal DNA identification，应用有细菌种属鉴定。

扩展资料：

在实验室中，主要是根据所用的鉴定仪器特点、感染性疾病的类型、标本种类、采集部位等因素建立具体的微生物学检验程序，大致步骤如下。

1、获得被鉴定菌种的纯培养菌落。

2、确定染色（革兰染色、抗酸染色）、形态和排列，按科、属、种依次鉴定下去。

3、运用知识、经验、最小数量的试验方法做出鉴定。

参考资料来源：-DNA测序

16sRNA怎样鉴定细菌

16s rRNA长度为1.5k多，作为菌种鉴定一般选择相似度97%的标准，相似度超过97%一般定义为同一种菌。

如果是sanger测序获得16s全长的都可以鉴定到种，甚至能区分亚种。有些细菌并不只有1个16s序列，会包含有1-15拷贝的16s序列，所以单一的16s序列鉴定可能会出现偏差。

利用高通量如454或miseq测序一般由于读长的缘故，通常只有300-500多个碱基被测序，所以在物种鉴定上一般比较可靠的是能分类到属，部分能分类到种。

根据我们的经验，不同的样品会有大约10-50的菌能分类到种。利用新的分析方法，我们现在也可以利用16s rRNA的群落多样性高通测序数据进行亚种级别的分析。主要是利用16s中共同变化的SNP位点进行分型。这样可以大大提高菌种的分类精度，尤其是在有些菌株之间表型差异巨大的时候。

16sRNA在细菌鉴定上起着什么样的作用

就是从基因水平上确定细菌属于哪个种属，但是就我了解，16S完全一样的菌，不一定是同一个种，还需要通过生理生化指标进一步确定。如果有价值，那就全基因组测序吧！

16srna同源序列分析什么意思

s是沉淀系数，16s表征的是RNA的大小，16sRNA是原核生物核糖体小亚基上的RNA。

这段RNA序列在不同的细菌中的结构、功能都具有高度保守性，完成测序后通过一些软件或者相关数据库可进行同源性比较，用于细菌的系统分类鉴定、多样性、亲缘关系分析等。

一般来说，16sRNA序列越接近，菌种亲缘关系越近，同源性越大；反之，16sRNA序列差异越大，同源性越小，

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